Auch einige Medikamente (z.B. Antibiotika, Medikamente in der Diabetes -Behandlung) können als Nebenwirkung Blähungen hervorrufen. Ist die Behandlung kurzzeitig, so verschwinden die Beschwerden bald nach Absetzen des Medikaments wieder. Wichtig ist es auch bei dauerhafter Behandlung die Medikamente nicht abzusetzen sondern die als Nebenwirkung auftretenden Blähungen mit Hilfe rezeptfreier Medikamente zu behandeln.

Medikamenten-Gruppe: Wirkstoffe sind zum Beispiel Mittel gegen Infektionenwie Penicilline, Sulfonamide, Mittel zur Diabetesbehandlung wie Acarbose, Mittel gegen Übergewicht wie Orlistat und Mittel gegen Entzündungen und Rheuma wie Diclofenac.

Manchen Menschen vertragen bestimmte Nahrungsmittel wie z.B. Milch schlechter als andere, weil ihnen bestimmte Enzyme (z.B. das Enzym Laktase) fehlen. Diese Nahrungsmittel werden dadurch unzureichend abgebaut. Etwa eine Stunde nach dem Verzehr kann es zu Blähungen oder sogar Durchfall kommen. Beispiele für derartige Unverträglichkeiten sind:

1. Milchzucker-Unverträglichkeit (Laktose-Intoleranz): Unverträglichkeit von Milch; Joghurt und Käse werden meist gut vertragen.
2. Fruchtzucker-Unverträglichkeit (Fruktose-Intoleranz) : Blähungen treten nach dem Verzehr von süßem Obst (z.B. Birnen) oder Fruchtsäften auf Zöliakie/Sprue (Gluten-Unverträglichkeit):
3. Unverträglichkeit von Eiweißen (z.B. Gluten) in einheimischen Getreidearten (z.B. Weizen, Gerste, Dinkel).

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