Zur Vorbereitung der Darmspiegelung muss der Darm zunächst gereinigt werden.

Das Instrument, mit dem eine Darmspiegelung durchgeführt wird, nennt man Koloskop. Es gehört zur Gruppe der Endoskope. Ein Koloskop ist also ein für die Darmuntersuchung speziell ausgelegtes Endoskop. Dieses Koloskop besteht aus einem teilbiegsamen Schlauch, mit einer an der Spitze befestigten Kamera. Es besteht aus biegsamen Glasfasern, die einen Durchmesser von ca. 10 Mikrometer haben.
Ein Glasfaserstrang ist aus  ca. 40000 einzelnen Fasern aufgebaut. Pro Faser wird ein Licht und ein Farbpunkt übertragen. So kann von der Spitze des Koloskops die durch die Kamera aufgefangenen Bilder entlang den Fasern weitergeleitet und auf einem Monitor sichtbar gemacht werden. Neben biegsamen Endoskopen gibt es auch starre Endoskope, die vor allem bei Untersuchungen des Enddarms zum Einsatz kommen, da hier nur eine kurze Strecke zurückgelegt werden muss. Soll hingegen der gesamte Dickdarm untersucht werden, wird ein 1m -1,5 m langes biegsamen Endoskop benötigt.

Neben der an der Spitze befestigten Kamera gibt es noch einen dem Schlauch entlangführenden Hohlraum, durch den man einen Draht hindurchführen kann, an dessen Spitze eine kleine Klemme ist. Durch die Klemme können Gewebeproben des Darms bei einer Darmspiegelung entnommen werden. Die Klemme ist von außen während der Untersuchung steuerbar. Des Weiteren befindet sich an der Koloskop Spitze ein sehr helles Licht, das während der Diagnostik eine geeignete Sicht  für den Untersucher gewährleisten soll. Des Weiteren kann über eine Koloskop noch Luft in den Darm eingegeben, sowie Flüssigkeit wieder abgesaugt werden.
Zur Vorbereitung der Darmspiegelung muss der Patient abführendes Medikament zu sich nehmen.