Bei dieser Roux En Y Bypass als Magenverkleinerung Technik wird ebenfalls ein Vormagen gebildet damit der Patient schneller beim Essen satt wird.
Zusätzlich wird an bei der Roux En Y Bypass Technik dem Vormagen eine Dünndarmschlinge angenäht, so dass die Nahrung einen Teil des Dünndarms umgeht und so zusätzlich weniger Nährstoffe aus der Nahrung aufgenommen werden.
Damit trotz der Umgehung des Zwölffingerdarms die Verdauungssäfte zur Nahrung kommen, muss eine weitere Dünndarmschlinge angenäht werden, die die Verdauungssäfte etwa 1-1,5 m nach der anderen Schlinge zuführt.
Diese Schlinge führt dann vom 12 Fingerdarm (der eigentlich die Fortsetzung des Magens ist) zu der anderen Schlinge. So führt diese Technik bewusst zu einer schlechten Aufnahme (Malabsroption) der Nahrung. Damit kommt es bei  der Roux En Y Bypass Technik zu einer schnelleren und größeren Gewichtsabnahme als bei den rein restriktiven Verfahren wie z.B. das Magenband.

Etwa vier Wochen nach der Operation können die Patienten wieder feste Nahrung zu sich nehmen. Meist berichten die Patienten von Übelkeit nach dem Verzehr von Süßigkeiten, dies ist durch den gestörten Verdauungstrakt zu erklären. Auch bei dieser Technik muss nach der Operation Vitamin B12, Mineralien und Eiweiß zeitlebens ergänzt werden.