Eine Sehnenscheidenentzündung kann folgende Ursachen besitzen:

• Mechanische Belastung
• Bakterielle Infektion
• Entzündlich-rheumatische Entzündung

Am häufigsten sind die Gründe für eine Sehnenscheidenentzündung mechanischer Natur. Bei Sportlern kommt es zum Beispiel durch zu schnelle Erhöhung der Belastungsintensität oder der Belastungsdauer zu diesem Krankheitsbild. Auch gehäufte gleichartige (stereotype) Arbeit in Verbindung mit einer Fehlhaltung resultiert in einer Sehnenscheidenentzündung, beispielsweise beim Tippen im Rahmen von Computerarbeit.
Seltener tritt eine Sehnenscheidenentzündung hingegen im Rahmen einer Infektion mit Bakterien oder auf rheumatischem Boden auf. Verursachende Erreger sind meistens Staphylokokken oder Streptokokken, die bei Verletzungen in die Sehnenscheiden eindringen und dort eine Infektion auslösen können.
Entzündlich-rheumatische Erkrankungen als Ursache einer Sehnenscheidenentzündung entstehen durch autoimmunologische Vorgänge des Körpers. Hierunter versteht man gewissermaßen einen Angriff des eigenen Abwehrsystems (Immunsystem) auf körpereigene Strukturen, in diesem Fall auf die Zellen der Sehnenscheiden. Ausgelöst werden diese Autoimmunreaktionen zum Beispiel durch Erreger wie Chlamydien, Gonokokken oder Mykoplasmen, die den Strukturen ähnelnde Bestandteile (Antigene) besitzen, welche später vom Immunsystem angegriffen werden.

Eine eigenständige Sonderform einer Sehnenscheidenentzündung bezeichnet die Tendovaginitis stenosans. Bei dieser handelt es sich um eine Verengung der Sehnenscheide (Stenose) mit Verdickung der hindurchlaufenden Sehne an den Fingern der Hand. Durch die beschriebenen Veränderungen ist der Durchgang der Sehne durch die Sehnenscheide erschwert und erfolgt mit einem schnalzenden Geräusch.
Betroffen sind die Sehnenscheiden der Fingerbeuger oder des kurzen Daumenstreckers (Musculus extensor pollicis brevis) und langen Daumenabspreizers (Musculus abductor pollicis longus). In letzterem Fall bezeichnet man das Krankheitsbild als Tendovaginitis stenosans de Quervain.