Von der schulmedizinischen Seite gibt es wenige Indikationen zum Heilfasten.  Für Heilfasten fehlen bislang wissenschaftliche Erkenntnisse und Beweise für das Helfen von Kuren. Auch sind von schulmedizinischer Seite keine klaren Indikationsstellungen definiert. Aus naturheilkundlicher und heilpraktischer Sicht gibt es allerdings sehrwohl eine Vielzahl von Indikationen / Anleitungen zum Fasten. Dem Hauptmechanismus, der dem Heilfasten zugrunde liegt, nämlich der Entschlackung und der Entgiftung des Körpers, werden der größte Stellenwert eingeräumt. Laut naturheilkundlicher Medizin kann mit dieser Entgiftungsmethode Patienten geholfen werden, die unter regelmäßigen Kopfschmerzen oder Migräne leiden, die Anlaufstörungen, Schlafstörungen, Gereiztheit, Nervosität, Mundgeruch, Rückenschmerzen und Gelenkschmerzen, Atemnot, Gefäßverengungen, Herzbeschwerden, Leistungsabfall, Depressionen, Vergesslichkeit sowie Allergien haben.
Des Weiteren kann im kosmetischen Bereich geholfen werden, denn laut naturheilkundlicher Medizin führt eine Fastenkur und die damit verbundene Entgiftung zu reinerer Haut, kräftigeren Haaren, Stimmungsaufhellungen, Straffung von Muskeln und Gewebe sowie Steigerung der Abwehrkräfte. Viele eine Fastenkur absolvierenden Patienten bestätigen während und nach der Fastenkur, dass sie Gerüche und Geschmäcker intensiver wahrnehmen als zuvor. Zum Abnehmen ist Heilfasten nicht geeignet. Der Zeitraum der meisten Fastenkuren ist so kurz, dass der Fettstoffwechsel kaum in Anspruch genommen wird. Zwar verlieren die meisten Patienten während einer Fastenkur einige Kilo an Gewicht, dies ist aber auf Wasserverluste zurückzuführen, die  während einer Fastenkur erhöht sind. Im Anschluss der Fastenkur wird das Körpergewicht wieder wie vorher evtl. 1-2 kg weniger, vorhanden sein.